1. 员工报销逾期扣减报销的合法性取决于公司的规章制度和的相关法律法规。以下是对此疑问的简要介绍：

2. 依照《人民劳动法》和《人民劳动合同法》公司有权制定内部规章制度对员工的报销表现实规范。若是公司规章制度中明确规定，员工逾期报销将扣减部分报销金额，且该规定合法、合理，那么这类做法是合法的。

3. 公司在制定相关制度时，理应保障制度的公平性和合理性。例如对不同类型的报销，可以设定不同的逾期扣减标准；同时公司理应为员工提供便捷的报销流程，以减少逾期报销的情况。

4. 假若公司在实际操作中，违反了相关法律法规或公司规章制度，对员工实行不合理的扣减，员工可依法维护本人的权益如向劳动监察部门投诉或申请仲裁。

员工报销逾期扣减报销的合法性需要结合公司规章制度和法律法规实行综合判断。