公司变更登记申请逾期解决步骤如下：

1. 及时补正相关材料：公司理应尽快准备齐全所有必要的变更登记材料，包含但不限于变更登记申请书、相关决议或决定、章程修正案等。

2. 提交补正申请：将准备好的材料提交至公司登记机关申请补正逾期变更登记。

3. 接受责令改正：依据《公司登记管理条例》的规定，公司登记机关会责令公司限期改正，并可能须要支付一定的逾期费用。

4. 缴纳罚款：倘若逾期变更属于首次发生按照具体情况可能免于处罚。但若非首次，则需遵循规定缴纳相应的罚款。

5. 办理变更登记：在完成补正材料和缴纳罚款后公司理应再次提交完整的变更登记申请，以便完成正式的变更登记手续。

6. 保障合规运营：为了避免未来的法律风险，公司应该保障所有变更后的信息合法律法规须要并持续合法合规运营。