和田玉证书上含有其他矿物质，具体含义如下：

1. 和田玉主要由透闪石和阳起石组成，但自然界中的玉石往往伴随着其他矿物质的共生。

2. 证书上标注“含有其他矿物质”意味着该和田玉样品中除了主要的透闪石成分外，还含有一定比例的其他矿物成分。

3. 这些其他矿物可能涵盖碳酸盐、石英、绿泥石、磁铁矿、铬尖晶石等这些成分一般不会超过2%。

4. 鉴定机构会在证书上备注这一信息，以表明样品中存在的矿物多样性，但只要透闪石成分符合标准仍然可被称为和田玉。

5. 若其他矿物成分含量过高，超出了国标规定的范围，则不会出具标准的和田玉鉴定证书。