赔偿参照养殖场上年度月平均生产(经营)成本以及重置固定资产、技术改造和安置职工等费用支出情况确定；对不合重建条件的企业停产、停业损失补偿标准。禁养区养殖场的补偿标准和经济损失的补偿，没有统一或者相关的政策或者法律、法规。这主要是由地方自由掌握。

因此，根据的规定，如果因环保问题而关停有手续的养殖场，应该由县级给予合理的补偿。若对于补偿，当地没有相关的法律规定，则应参照征地拆迁的相关规定进行评估。

养殖场停产停业损失补偿标准是:土地的补偿，按照土地管理法的相关的年产6倍之上来进行补偿。对地上附着物的补偿。厂房的补偿，由有资质的评估机构现场评估。养殖场关停有以下补偿:关停养殖场的土地补偿费，按该土地年产值的五倍计算；安置补助费以及农村村民住宅的补偿费用。

实践中，各地对“禁养”关停养殖场应当给予的停产停业计算标准是不一致的，各个企业的盈利亏损情况也各不相同，而且养殖场在这一补偿目上又具有相当的特殊性。(3)养殖场停业、停产的补偿，补偿多少要根据养殖场的收入高低、规模大小等因素来决定。 (4)搬迁补偿，养殖场一般都是规模化的，不管规模大小都是需要一直进行养殖工作的。